El 22 de mayo de 1972 se expidió el Decreto Supremo No. 375-A, publicado en el Registro Oficial No. 84 del 20 de junio del mismo año, mediante el cual se crea el Instituto de Altos Estudios Nacionales.
El Congreso Nacional al considerar el valioso aporte que el Instituto venía proporcionando al país, a través de la preparación de profesionales civiles y militares, con un conocimiento cabal de la realidad y de los problemas que afectan al país, expide la Ley No. 124 el 5 de julio de 1996, mediante la cual reconoce al IAEN como una entidad académica superior de postgrado, con personería jurídica y sin fines de lucro.
El 15 de mayo del año 2000, se publica en el Registro Oficial No. 77, la Ley Orgánica de Educación Superior, expedida por el Congreso Nacional. En la disposición general undécima, la mencionada Ley reconoce “al Instituto de Altos Estudios Nacionales como un centro de educación superior que funciona de acuerdo con la Ley de su creación y realiza actividades académicas en el nivel de postgrado”.
En el año 2008, concretamente el 9 de abril, mediante Decreto Ejecutivo 1011, el presidente Rafael Correa dispuso la reorganización del Instituto de Altos Estudios Nacionales y su adscripción a la Secretaría Nacional de Planificación y Desarrollo, SENPLADES. Es así como el IAEN se constituye en la Universidad de postgrado del Estado, por lo tanto es la instancia encargada de la formación de los funcionarios públicos al más alto nivel.

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